Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPOCK3Q9BQ16 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms