Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOPXQ9BPY8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOPXQ9BPY8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms