Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEMA3CQ99985 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms