Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRG3Q99928 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms