Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COPS8Q99627 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms