Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms