Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EYA1Q99502 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EYA1Q99502 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms