Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CICQ96RK0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms