Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SORCS2Q96PQ0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms