Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC7Q96M83 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms