Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DCHS1Q96JQ0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DCHS1Q96JQ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms