Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS50Q96JG6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms