Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCMH1Q96GD3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCMH1Q96GD3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms