Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM3DQ96BQ1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FAM3DQ96BQ1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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