Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRUQ92729 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRUQ92729 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
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