Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTTNBP2Q8WZ74 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTTNBP2Q8WZ74 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTTNBP2Q8WZ74 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms