Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNX29Q8TEQ0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms