Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM3Q8NE01 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM3Q8NE01 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms