Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACBD4Q8NC06 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms