Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP38Q8NB14 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP38Q8NB14 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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