Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN19Q8N6F1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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CLDN19Q8N6F1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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CLDN19Q8N6F1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CLDN19Q8N6F1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CLDN19Q8N6F1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN19Q8N6F1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms