Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IGSF1Q8N6C5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGSF1Q8N6C5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms