Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRC18Q8N456 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms