Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
VPS8Q8N3P4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VPS8Q8N3P4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms