Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ANKRD35Q8N283 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ANKRD35Q8N283 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms