Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS37DQ86XT2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37DQ86XT2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms