Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms