Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC73Q6ZRK6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC73Q6ZRK6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms