Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 GNS-205ENST00000540883 544 ntTSL 35.87□□□□□ -1.472e-16■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 EOGT-207ENST00000496647 3624 ntTSL 25.86□□□□□ -1.472e-16■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.484e-10■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.499e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 RGS5-213ENST00000427213 616 ntTSL 35.73□□□□□ -1.499e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 RGS5-211ENST00000534288 591 ntTSL 45.73□□□□□ -1.499e-9■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 RGS5-207ENST00000530241 576 ntTSL 35.73□□□□□ -1.499e-9■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.519e-9■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.569e-9■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.574e-10■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.732e-16■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 KIAA1524-205ENST00000487834 2014 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.273e-7■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.549e-7■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 LRP8-206ENST00000460214 775 ntTSL 36.78□□□□□ -1.324e-8■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 LRP8-210ENST00000481431 627 ntTSL 34.95□□□□□ -1.626e-8■■■■■ 32.9
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PRPF8Q6P2Q9 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.735e-7■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.91e-8■■■■■ 32.9
PRPF8Q6P2Q9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 32.9
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