Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRNP1Q6NT89 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms