Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCSAPQ6IQ19 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCSAPQ6IQ19 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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