Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 999 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCTP1Q6DN14 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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