Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXNDC8Q6A555 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXNDC8Q6A555 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms