Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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FAM208BQ5VWN6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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FAM208BQ5VWN6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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FAM208BQ5VWN6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM208BQ5VWN6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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