Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf135Q5VTT2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms