Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms