Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDSS1Q5T2R2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms