Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATAD3CQ5T2N8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms