Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRRT3Q5FWE3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRRT3Q5FWE3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms