Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAVIN4Q5BKX8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN4Q5BKX8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms