Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTXN3Q4LDR2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTXN3Q4LDR2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms