Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP100Q494V2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
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