Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRFIP1Q32MZ4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRFIP1Q32MZ4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms