Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR2Q2VWA4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKOR2Q2VWA4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms