Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL40Q2TBA0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms