Protein–RNA interactions for Protein: Q29RF7

PDS5A, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5AQ29RF7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDS5AQ29RF7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDS5AQ29RF7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms