Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CA9Q16790 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CA9Q16790 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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CA9Q16790 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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CA9Q16790 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CA9Q16790 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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