Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK2Q16620 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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