Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPE65Q16518 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms