Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNXAQ16473 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms